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个性化剖析儿童血液肿瘤典型基因突变

发布时间:2019/06/01

儿童白血病是儿童中最高发的恶性肿瘤,以急性淋巴细胞白血病最为常见。儿童白血病突变基因种类与成人差异较大,具有独立的研究价值。本文通过分享一例儿童白血病NGS检测案例,介绍一些儿童血液肿瘤中比较有特点的基因突变。

 

 

 

案例介绍

 

患者信息

患者信息 丨  4岁,男性,初诊淋巴结肿大,怀疑急性白血病

详细信息丨 白细胞计数5.78×109/L,血红蛋白99g/L,血小板计数238×109/L。

送检金橡医学进行橡泰™儿童血液肿瘤基因检测。

检测结果

 

☑ NSD2基因发生错义突变,导致基因编码蛋白第1099位的谷氨酸变为赖氨酸,为热点激活突变,常在B-ALL患者中出现。NSD2基因又名WHSC1,所编码蛋白是一种甲基转移酶,可催化组蛋白H3 特定赖氨酸残基(H3K36) 的甲基化,在表观遗传调节中发挥重要作用。

☑ FLT3基因发生非移码删除突变,导致14号外显子7个氨基酸的删除,该类型的FLT3突变仅在儿童血液病患者中存在。FLT3基因为膜结合酪氨酸激酶受体,在调节造血细胞增殖、生存、黏附、迁移中起重要作用。

 

 

分析与讨论

 

1.  辅助确诊:NSD2基因的p.E1099K突变几乎仅在B-ALL患者中检出,可以帮助确定患者罹患B-ALL;

2.  潜在用药价值:NSD2基因的p.E1099K突变为SET结构域上的激活突变,有研究认为该甲基转移酶的抑制剂为一个潜在的药物开发方向;

 

 

 

 

图1 儿童ALL患者中NDS2(WHSC1)基因突变特点 L Ding et al, 2017

 

3.  儿童特有突变:FLT3基因为血液病中非常常见的突变基因,FLT3 突变主要包括内部串联重复(FLT3-ITD)和酪氨酸激酶结构域点突变(FLT3-TKD)两种突变形式。但该患者发生的突变既不是ITD也不是TKD突变,为儿童特有突变形式,在儿童AML和儿童ALL中都有报道。有研究认为发生突变的区域与调节FLT3蛋白的二聚化和自激活相关。

 

 

 

 

图2 儿童ALL患者中FLT3基因突变特点 L Ding et al, 2017

 

综上,儿童血液肿瘤有着相对成人非常独特的突变谱系,甚至存在一些仅在儿童患者中发生的突变类型。对这些突变进行深入研究,乃至后续对这些特殊位点进行药物开发,具有很大的潜在临床价值。

 

 

参考文献

 

1. Ding L W, Sun Q Y, Tan K T, et al. Mutational landscape of pediatric acute lymphoblastic leukemia[J]. Cancer research, 2017, 77(2): 390-400.

2. Ma X, Edmonson M, Yergeau D, et al. Rise and fall of subclones from diagnosis to relapse in pediatric B-acute lymphoblastic leukaemia[J]. Nature communications, 2015, 6: 6604.

3. Bolouri H, Farrar J E, Triche Jr T, et al. The molecular landscape of pediatric acute myeloid leukemia reveals recurrent structural alterations and age-specific mutational interactions[J]. Nature medicine, 2018, 24(1): 103.

 

 


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