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重磅学术成果 | 首次揭秘中国人群特异基因组特征,辅助UTUC精准诊断

发布时间:2021/06/10

 

 近日,北京大学第一医院何志嵩教授团队与金橡医学合作文章“Comparison of genomic characterization in upper tract urothelial carcinoma and urothelial carcinoma of the bladder”正式发表于The oncologist  (IF=5.025)。该研究为进一步理解上尿路尿路上皮癌(UTUC)和膀胱癌(UCB)之间独特的分子机制奠定了基础,并对尿路上皮癌患者的不同组织类型特异性管理具有重要意义, 为UTUC精准诊断提供新筛选工具。

 

» 研究方法

本研究对118例中国尿路上皮癌患者(45例UTUC和73例UCB)进行橡翼808靶向测序。

 

» 研究结果

1.UTUC和UCB突变图谱差异

KMT2D、TP53和BRD4突变是尿路上皮癌中最常见突变基因。8个基因在不同肿瘤部位存在显著差异。INRRL1突变只发生在UCB中。UTUC中KMT2C、LRP1B、NCOR1、ZFHX4、KDR、NF1和NOTCH基因的突变突变频率显著高于UCB。

 

2.分子突变特征差异

UTUC和UCB均存在signature 1(5 -甲基胞嘧啶的自发脱氨反应),虽然两组均有APOBEC胞苷脱氨酶信号,但均投射到不同的COSMIC signature 中(分别为signature 2和signature 13),差异率分别为32.41%和42.99%。Signature 22(马兜铃酸暴露)和signature 10 (聚合酶POLE缺陷)仅存在UTUC患者中。而signature 6(DNA错配修复缺陷)只存在于UCB队列。

 

3.UTUC和UCB从免疫治疗中获益差异

UTUC患者PD-L1阳性比率显著低于UCB患者(17.78% vs 31.51%).而其他免疫治疗marker如DDR(60% vs 71%),TMB,CNV拷贝数等无显著差异。

 

4.UTUC和UCB从靶向治疗中获益差异

82.22%的UTUC患者至少存在一个临床可作用基因,53.33%可能从靶向治疗中获益(图6A)。82.19%的UCB患者至少存在一个临床可作用基因,包括54.79%患者可能从靶向治疗中获益。两组接受靶向药物的比率相似,而KIT、NRAS和CDKN2A只存在于UTUC,而EGFR、MDM2、CDK4和BRCA2存在于UCB。

 

» 研究结论

UTUC和UCB分子机制差异的探索可能对尿路上皮癌患者的特异性管理具有重要意义。突变标记可作为一种筛查工具,以协助临床鉴别诊断UTUC和UCB。

 

 

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