文章发表|性能优异!自主研发AcornHRD算法有效筛选蒽环类药物新辅助化疗的乳腺癌获益患者
2024/10/24
BRCA1/2和其他HRR基因突变的肿瘤可对DNA双链断裂诱导的治疗剂如PARP抑制剂或铂敏感。但大部分乳腺癌患者仍无法从BRCA检测中获益。已有多项临床试验证实,同源重组修复缺陷(HRD)检测能够发现更多获益人群。最近有报道称,HRD评分高的乳腺癌在新辅助治疗中对蒽环类药物更敏感。因此,HRD检测可能为乳腺癌患者提供更精准的新辅助治疗建议。然而HRD检测方法多种多样且存在争议,目前国内尚无统一的标准。
基于此,浙江省肿瘤医院曹文明主任团队和金橡医学合作,开发出基于中国人群基因组特征的新型HRD评分算法AcornHRD,在不同队列中与国外的ShallowHRD算法的性能进行比较,并评估了HRD评分与BRCA突变和蒽环类药物新辅助化疗(NAC)病理完全缓解(pCR)之间的相关性,以验证算法的准确性。结果表明通过使用AcornHRD算法评估,大片段拷贝数变异(LCNA)在乳腺癌HRD检测具有高性能,为预测蒽环类新辅助治疗疗效的潜在生物标志物提供医学依据。相关研究结果已被European Journal of Medical Research杂志(IF=4.2)在线发表。